Seminario de Secuenciación mediante nanoporos y sus aplicaciones
Formato mixto: Aula Severo Ochoa & TEAMS Horario: 10:30 h. a 13:30 h.
El 13 de diciembre tendrá lugar en formato mixto el Seminario de Secuenciación mediante nanoporos y sus aplicaciones, en el Aula Severo Ochoa del Hospital Universitario Fundación Jiménez Díaz y a través de conexión remota vía Teams, de 10.30 h. a 13.30 h.
Este seminario está organizado por el grupo de investigación de Genética y Genómica de Enfermedades Raras y Complejas del IIS-FJD.
Actividad formativa destinada al personal de investigación del IIS-FJD, en el marco del Plan de Formación 2023.
PROGRAMA
1.Introducción.
Fundamentos de la Secuenciación con nanoporos. Bases de este tipo de secuenciación genómica. Comparación con otras técnicas. Marta Cortón y Cristina Rodilla.
2.Aplicaciones de la Secuenciación con nanoporos.
Plataformas de secuenciación. Comparación de las plataformas de nanoporos disponibles. Marta Cortón y Cristina Rodilla.
Opciones de kits disponibles y diseño de experimentos. Requerimientos según el tipo de aplicación. Marta Cortón y Cristina Rodilla.
Resultados y análisis bioinformático. Adquisición de datos y procesamiento. Ejemplos de software y recursos bioinformáticos necesarios. Pablo Mínguez.
3.Ejemplos prácticos.
Identificación de variantes. Análisis de variantes puntuales y determinación precisa de variantes estructurales. Cristina Rodilla.
Interpretación del efecto de variantes de splicing. Marta Cortón y Carolina Ruiz
4.Conclusiones y preguntas.