Microbiología

Resumen de actividad

El grupo realiza investigación sobre las causas, la patogenia, el diagnóstico y el tratamiento de las enfermedades infecciosas. Destaca el estudio de infecciones asociadas a implantes y micobacterias, desarrollo de nuevos tratamientos (bacteriófagos, nanopartículas) y técnicas diagnósticas (biología molecular).

Contribuciones a la sociedad

El Dr. Jaime Esteban: Descripción de la técnica de sonicación para el diagnóstico de infecciones asociadas a implantes. Participación en guías y documentos de consenso nacionales e internacionales sobre el manejo de estas infecciones. Protocolos y documentos de consenso nacionales sobre micobacterias. Participación en el Plan Nacional contra la Tuberculosis.

Colaboraciones

El grupo de Microbiología colabora con diversos grupos nacionales a través del consorcio CIBERINFEC, en el que participa en un grupo multicéntrico y mutidisciplinar con investigadores del IIS, CENIM-CSIC, Universidad Carlos III, Hospitales La Paz, 12 de octubre y Bellvitge. El grupo además pertenece al CIBEREHD. Colabora también con diversos grupos nacionales en infección osteoarticular y en micobacterias a través de los respectivos grupos de trabajo (GEIO y GEIM) de la SEIMC y de la SMMC (grupo de Micobacterias de Madrid), y con la Universidad Complutense de Madrid. El estudio de variabilidad de virus se hace en colaboración con el Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa" (CSIC-UAM), el Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) y el Instituto de Biología Molecular de Barcelona (IBMB) a través de la plataforma PTI Salud Global. También colabora con grupos europeos a través de los grupos de trabajo ESGIAI, ESGB y ESGMYC de la ESCMID, y con colaboraciones puntuales con las Universidades de Helsinki, Aarhus, Gante y Ohio State, así como con diversos centros de referencia internacionales. Las colaboraciones se han establecido sobre la base de la realización de estudios de biomateriales, nuevos tratamientos, infecciones asociadas a implantes, infecciones nosocomiales e infecciones por micobacterias. Respecto a las colaboraciones relacionadas con fagoterapia, destacan grupos nacionales a través de la red FAGOMA como el Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC), IPLA-CSIC de Asturias, I2SysBio-Universidad de Valencia o internacionales como el Hospital de la Croix Rousse de los Hospices Civils de Lyon.

Tesis doctorales

6.2.3-MICROBIOLOGÍA-TESIS

Relación de publicaciones ordenadas por fecha de publicación

Sanguiin H-6 Fractionated from Cloudberry (Rubus chamaemorus) Seeds Can Prevent the Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Biofilm Development during Wound Infection.

Aguilera-Correa JJ, Fernández-López S, Cuñas-Figueroa ID, Pérez-Rial S, Alakomi HL, Nohynek L, Oksman-Caldentey KM, Salminen JP, Esteban J, Cuadros J, Puupponen-Pimiä R, Perez-Tanoira R, Kinnari TJ

Antibiotics. 2021 Dec 3;10(12):1481.

PMID: 34943693

FI: 4,639

A Two-Level, Intramutant Spectrum Haplotype Profile of Hepatitis C Virus Revealed by Self-Organized Maps.

Delgado S, Perales C, García-Crespo C, Soria ME, Gallego I, de Ávila AI, Martínez-González B, Vázquez-Sirvent L, López-Galíndez C, Morán F, Domingo E

Microbiology spectrum. Epub 2021 Nov 10. 2021 Dec 22;9(3):e0145921.

PMID: 34756074

FI: 7,171

Akt Phosphorylation of Hepatitis C Virus NS5B Regulates Polymerase Activity and Hepatitis C Virus Infection.

Sabariegos R, Albentosa-González L, Palmero B, Clemente-Casares P, Ramírez E, García-Crespo C, Gallego I, de Ávila AI, Perales C, Domingo E, Mas A

Frontiers in microbiology. 2021 Oct 22;12:754664.

PMID: 34745059

FI: 5,64

Antibiotics- and Heavy Metals-Based Titanium Alloy Surface Modifications for Local Prosthetic Joint Infections.

Esteban J, Vallet-Regí M, Aguilera-Correa JJ

Antibiotics. 2021 Oct 19;10(10):1270.

PMID: 34680850

FI: 4,639

Proinflammatory Cytokine Profile Differences between Primary Open-Angle and Pseudoexfoliative Glaucoma.

Vidal-Villegas B, Burgos-Blasco B, Santiago Alvarez JL, Espino-Paisán L, Fernández-Vigo J, Andrés-Guerrero V, García-Feijoo J, Martínez-de-la-Casa JM

Ophthalmic research. Epub 2021 Oct 18. 2022;65(1):111-120.

PMID: 34662885

FI: 2,892

High SARS-CoV-2 viral load is associated with a worse clinical outcome of COVID-19 disease.

Soria ME, Cortón M, Martínez-González B, Lobo-Vega R, Vázquez-Sirvent L, López-Rodríguez R, Almoguera B, Mahillo I, Mínguez P, Herrero A, Taracido JC, Macías-Valcayo A, Esteban J, Fernandez-Roblas R, Gadea I, Ruíz-Hornillos J, Ayuso C, Perales C

Access microbiology. 2021 Sep 21;3(9):000259.

PMID: 34712904

FI: 0

Historical Perspective on the Discovery of the Quasispecies Concept.

Domingo E, García-Crespo C, Perales C

Annual review of virology. 2021 Sep 29;8(1):51-72.

PMID: 34586874

FI: 10,431

Mutation Rates, Mutation Frequencies, and Proofreading-Repair Activities in RNA Virus Genetics.

Domingo E, García-Crespo C, Lobo-Vega R, Perales C

Viruses. 2021 Sep 21;13(9):1882.

PMID: 34578463

FI: 5,048

Prognosis of unexpected positive intraoperative cultures in arthroplasty revision: A large multicenter cohort.

Mancheño-Losa M, Lora-Tamayo J, Fernández-Sampedro M, Rodríguez-Pardo D, Muñoz-Mahamud E, Soldevila L, Palou M, Barbero JM, Del Toro MD, Iribarren JA, Sobrino B, Rico-Nieto A, Guío-Carrión L, Gómez L, Escudero-Sánchez R, García-País MJ, Jover-Sáenz A, Praena J, Baraia-Etxaburu JM, Auñón Á, Múñez-Rubio E, Murillo O, List of study collaborators. (Jaime Esteban, Joaquín García-Cañete)

The Journal of infection. Epub 2021 Sep 9. 2021 Nov;83(5):542-549.

PMID: 34509512

FI: 6,072

A novel bis(pyrazolyl)methane compound as a potential agent against Gram-positive bacteria.

Seguí P, Aguilera-Correa JJ, Domínguez-Jurado E, Sánchez-López CM, Pérez-Tanoira R, Ocaña AV, Castro-Osma JA, Esteban J, Marcilla A, Alonso-Moreno C, Pérez-Martínez FC, Molina-Alarcón M

Scientific reports. 2021 Aug 11;11(1):16306.

PMID: 34381091

FI: 4,38

Genomic Analysis of Cutibacterium acnes Strains Isolated from Prosthetic Joint Infections.

Salar-Vidal L, Achermann Y, Aguilera-Correa JJ, Poehlein A, Esteban J, Brüggemann H, On Behalf Of The Escmid Study Group For Implant-Associated Infections Esgiai

Microorganisms. 2021 Jul 14;9(7):1500.

PMID: 34361935

FI: 4,128

Corrigendum: Considerations for Phage Therapy Against Mycobacterium abscessus.

Senhaji-Kacha A, Esteban J, Garcia-Quintanilla M

Frontiers in microbiology. 2021 Jul 14;12:722831.

PMID: 34335555

FI: 5,64

Partial restoration of immune response in Hepatitis C patients after viral clearance by direct-acting antiviral therapy.

Llorens-Revull M, Costafreda MI, Rico A, Guerrero-Murillo M, Soria ME, Píriz-Ruzo S, Vargas-Accarino E, Gabriel-Medina P, Rodríguez-Frías F, Riveiro-Barciela M, Perales C, Quer J, Sauleda S, Esteban JI, Bes M

PloS one. 2021 Jul 9;16(7):e0254243.

PMID: 34242330

FI: 3,24

A New Antifungal-Loaded Sol-Gel Can Prevent Candida albicans Prosthetic Joint Infection.

Garlito-Díaz H, Esteban J, Mediero A, Carias-Cálix RA, Toirac B, Mulero F, Faus-Rodrigo V, Jiménez-Morales A, Calvo E, Aguilera-Correa JJ

Antibiotics. 2021 Jun 12;10(6):711.

PMID: 34204833

FI: 4,639

Phages in Food Industry Biocontrol and Bioremediation.

Cristobal-Cueto P, García-Quintanilla A, Esteban J, García-Quintanilla M

Antibiotics. 2021 Jun 28;10(7):786.

PMID: 34203362

FI: 4,639

Advances in Bacteriophage Therapy against Relevant MultiDrug-Resistant Pathogens.

Broncano-Lavado A, Santamaría-Corral G, Esteban J, García-Quintanilla M

Antibiotics. 2021 Jun 4;10(6):672.

PMID: 34199889

FI: 4,639

Association of Polymorphisms in T-Cell Activation Costimulatory/Inhibitory Signal Genes With Allograft Kidney Rejection Risk.

Santiago JL, Sánchez-Pérez L, Pérez-Flores I, de la Higuera MAM, Romero NC, Querol-García J, Urcelay E, Sánchez-Fructuoso AI

Frontiers in immunology. 2021 Jun 2;12:650979.

PMID: 34149691

FI: 7,561

Cutibacterium spp. isolated from orthopaedic implant-associated infection: A not-so-slowly growing organism.

Salar-Vidal L, Martin-Garcia M, Auñón A, Esteban J

Enfermedades infecciosas y microbiologia clinica. 2021 Jun-Jul;39(6):287-290.

PMID: 34088450

FI: 1,731

A Janus-Faced Bacterium: Host-Beneficial and -Detrimental Roles of Cutibacterium acnes.

Brüggemann H, Salar-Vidal L, Gollnick HPM, Lood R

Frontiers in microbiology. 2021 May 31;12:673845.

PMID: 34135880

FI: 5,64

Population Disequilibrium as Promoter of Adaptive Explorations in Hepatitis C Virus.

García-Crespo C, Gallego I, Soria ME, de Ávila AI, Martínez-González B, Vázquez-Sirvent L, Lobo-Vega R, Moreno E, Gómez J, Briones C, Gregori J, Quer J, Domingo E, Perales C

Viruses. 2021 Apr 3;13(4):616.

PMID: 33916702

FI: 5,048

Rapid decline of anti-SARS-CoV-2 antibodies in patients on haemodialysis: the COVID-FRIAT study.

Alcázar-Arroyo R, Portolés J, López-Sánchez P, Zalamea F, Furaz K, Méndez Á, Nieto L, Sánchez-Hernández R, Pizarro S, García A, Pereira M, Gallego-Valcárcel E, Llópez-Carratala R, Gadea-Gironés I, Martín R, Miranda B, COVID-FRIAT study group .

Clinical kidney journal. Epub 2021 Jul. 2021 Mar 9;14(7):1835-1844.

PMID: 34211708

FI: 4,452

Epidemiology and in vitro antimicrobial susceptibility of aerobic Actinomycetales in a clinical setting.

Salar-Vidal L, Martín-García M, Macías-Valcayo A, Ponz A, Esteban J

Enfermedades infecciosas y microbiologia clinica. 2021 Mar 31;S0213-005X(21)00075-6.

PMID: 33812738

FI: 1,731

An update about molecular biology techniques to detect orthopaedic implant-related infections.

Esteban J, Gómez-Barrena E

EFORT open reviews. 2021 Feb 1;6(2):93-100.

PMID: 33828851

FI: 4,618

Identification and validation of clinical phenotypes with prognostic implications in patients admitted to hospital with COVID-19: a multicentre cohort study.

Gutiérrez-Gutiérrez B, Del Toro MD, Borobia AM, Carcas A, Jarrín I, Yllescas M, Ryan P, Pachón J, Carratalà J, Berenguer J, Arribas JR, Rodríguez-Baño J, REIPI-SEIMC COVID-19 group and COVID@HULP groups.(Cabello A, Carrasco-Anton N, Álvarez B, Petkova E, Gorgolas M, Prieto-Pérez L, Carrillo I, Heili Frades S, Villar-Álvarez F, Fernandez-Roblas R, Sánchez-Pernaute O)

The Lancet. Infectious diseases. Epub 2021 Feb 23. 2021 Jun;21(6):783-792.

PMID: 33636145

FI: 25,071

Impact of sink removal from intensive care unit rooms on the consumption of antibiotics and on results of Zero Resistance Project.

De-Las-Casas-Cámara G, Collados-Arroyo V, García-Torrejón MC, Muñoz-Egea MC, Martín-Ríos MD

Medicina clinica. 2021 Feb 13;S0025-7753(20)30872-1.

PMID: 33593639

FI: 1,725

Arabic gum plus colistin coated moxifloxacin-loaded nanoparticles for the treatment of bone infection caused by Escherichia coli.

Aguilera-Correa JJ, Gisbert-Garzarán M, Mediero A, Carias-Cálix RA, Jiménez-Jiménez C, Esteban J, Vallet-Regí M

Acta biomaterialia. Epub 2021 Oct 13. 2022 Jan 1;137:218-237.

PMID: 34653694

FI: 8,947

Statin use is associated with reduced mortality after respiratory viral infection.

Franco-Peláez JA, Esteban-Lucia L, Zambrano Chacón MLÁ, Pello-Lázaro AM, Venegas Rodriguez AM, Nieto Roca L, García-Talavera CS, Kallmeyer Mayor A, Villar Alvarez F, Fernandez Roblas R, Gonzalez-Lorenzo O, Tuñón J, Ibañez B, Aceña A

ERJ open research. Epub 2021 Jan. 2021 Feb 1;7(1):00365-2020.

PMID: 33569498

FI: 0

Antibody response in patients admitted to the hospital with suspected SARS-CoV-2 infection: results from a multicenter study across Spain.

Fuentes A, Serrano-Conde E, Roldán C, Benito-Ruesca R, Mejías G, Sampedro A, March-Roselló G, Fernández-Natal I, Esperalba J, Rodríguez MJ, Martínez de Aguirre P, Salas C, Roc ML, Soria LM, Parra-Grande M, Montero MD, Fernández-Roblas R, Franco-Álvarez de Luna F, Lozano C, García F

European journal of clinical microbiology &infectious diseases. Epub 2021 Jan 29. 2021 Jun;40(6):1343-1349.

PMID: 33512616

FI: 3,267

Diagnostic Accuracy of the Panbio Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Antigen Rapid Test Compared with Reverse-Transcriptase Polymerase Chain Reaction Testing of Nasopharyngeal Samples in the Pediatric Population.

Villaverde S, Domínguez-Rodríguez S, Sabrido G, Pérez-Jorge C, Plata M, Romero MP, Grasa CD, Jiménez AB, Heras E, Broncano A, Núñez MDM, Illán M, Merino P, Soto B, Molina-Arana D, Bermejo A, Mendoza P, Gijón M, Pérez-Moneo B, Moraleda C, Tagarro A, Epidemiological Study of COVID-19 in Children of the Spanish Society of Pediatric (EPICO-AEP) Working Group.

The Journal of pediatrics. Epub 2021 Jan 21. 2021 May;232:287-289.e4.

PMID: 33484697

FI: 4,406

The time for COVID-19 vaccination.

Domingo E, Perales C

Journal of virology. 2021 Jan 19;95(8):e02437-20.

PMID: 33468542

FI: 5,103

Inorganic and Polymeric Nanoparticles for Human Viral and Bacterial Infections Prevention and Treatment.

Aguilera-Correa JJ, Esteban J, Vallet-Regí M

Nanomaterials. 2021 Jan 8;11(1):137.

PMID: 33435597

FI: 5,076

Impact of the use of molecular techniques (PCR) on detection and eradication success against Helicobacter pylori.

Gallardo Padilla M, León Falconi JL, Sánchez-Nebreda Arias R, Gómez Santos C, Muñoz Egea MDC, la Orden Izquierdo E

Anales de pediatria. 2021 Jan 8;S1695-4033(20)30502-6.

PMID: 33431330

FI: 1,5

Evaluating bedaquiline as a treatment option for multidrug-resistant tuberculosis.

Martín-García M, Esteban J

Expert opinion on pharmacotherapy. Epub 2021 Jan 4. 2021 Apr;22(5):535-541.

PMID: 33393406

FI: 3,889