Microbiología

Resumen de actividad

El grupo realiza investigación sobre las causas, la patogenia, el diagnóstico y el tratamiento de las enfermedades infecciosas. Destaca el estudio de infecciones asociadas a implantes y micobacterias, desarrollo de nuevos tratamientos (bacteriófagos, nanopartículas) y técnicas diagnósticas (biología molecular).

Contribuciones a la sociedad

El Dr. Jaime Esteban: Descripción de la técnica de sonicación para el diagnóstico de infecciones asociadas a implantes. Participación en guías y documentos de consenso nacionales e internacionales sobre el manejo de estas infecciones. Protocolos y documentos de consenso nacionales sobre micobacterias y fagoterapia. Participación en el Plan Nacional contra la Tuberculosis.

La Dra. Meritxell García Quintanilla: Participación en el primer protocolo nacional de terapia de fagos y primer proyecto multicéntrico sobre fagoterapia en España.

Colaboraciones

El grupo de Microbiología colabora con diversos grupos nacionales relacionados con enfermedades infecciosas y microbiología clínica a través del consorcio CIBERINFEC, en el que participa en un grupo multicéntrico y multidisciplinar con investigadores del IIS, CENIM-CSIC, Universidad Carlos III, Hospitales La Paz, 12 de octubre, Santa Creu y Sant Pau y Bellvitge. El grupo además pertenece al CIBEREHD. Colabora también con diversos grupos nacionales en infección osteoarticular y en micobacterias a través de los respectivos grupos de trabajo (GEIO y GEIM) de la SEIMC y de la SMMC (grupo de Micobacterias de Madrid), y con la Universidad Complutense de Madrid. El estudio de variabilidad de virus se hace en colaboración con el Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa" (CSIC-UAM), el Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) y el Instituto de Biología Molecular de Barcelona (IBMB) a través de la plataforma PTI Salud Global. También colabora con grupos europeos a través de los grupos de trabajo ESGIAI, ESGB y ESGMYC de la ESCMID, y con colaboraciones puntuales con las Universidades de Helsinki, Aarhus, Gante y Ohio State, así como con diversos centros de referencia internacionales. Las colaboraciones se han establecido sobre la base de la realización de estudios de biomateriales, nuevos tratamientos, infecciones asociadas a implantes, infecciones nosocomiales e infecciones por micobacterias. Respecto a las colaboraciones relacionadas con fagoterapia, destacan grupos nacionales como el Instituto de Investigación Biomédica (INIBIC) - Hospital Universitario de La Coruña, el Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas (CBGP) UPM-INIA de Madrid, grupos a través de la red FAGOMA como el Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC), Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva - Universidad de Valencia, o internacionales como el Hospital de la Croix Rousse de los Hospices Civils de Lyon y el Instituto de Recherche en Infectiologie de Montpellier (IRIm - CNRS).

Tesis doctorales

02-INFECCIOSAS-Microbiologia-tesis

Relación de publicaciones ordenadas por fecha de publicación

A general and biomedical perspective of viral quasispecies.

Domingo E, Martínez-González B, Somovilla P, García-Crespo C, Soria ME, de Ávila AI, Gadea I, Perales C.

RNA. 2024 Dec 23.

PMID: 39689947

FI: 4,2

In vivo reduction of biofilm seeded on orthopaedic implants.

Cordero García-Galán E, Medel-Plaza M, Pozo-Kreilinger JJ, Sarnago H, Lucía Ó, Rico-Nieto A, Esteban J, Gomez-Barrena E.

Bone Joint Res. 2024 Dec 01.13(12):695-702.

PMID: 39615517

FI: 4,7

Bacteriophage Therapy as a Promising Alternative for Antibiotic-Resistant Enterococcus faecium: Advances and Challenges.

Ribes-Martínez L, Muñoz-Egea MC, Yuste J, Esteban J, García-Quintanilla M.

Antibiotics (Basel). 2024 Nov 23.13(12).

PMID: 39766510

FI: 4,3

Outcomes of the Subsequent Periprosthetic Joint Infection Revisions after a Failed Debridement, Antibiotics and Implant Retention: A Multicentric Study of 197 Patients.

Auñón Á, Bernaus M, Veloso M, Font-Vizcarra L, Esteban J, Mijangos M, Hernández N, Achaerandio A, Baeza J, Argüelles F, Rojas R, Sánchez J, Martínez-Roselló A, Monfort M, Martínez J, Corredor A, de Espinosa JML, Castellanos J, Martínez Pastor JC, Alías A, Boadas L, Muñoz-Mahamud E, Sabater M.

Surg Infect (Larchmt). 2024 Nov 29.

PMID: 39612194

FI: 1,4

Extended sequential intravenous and oral antimicrobial therapy improves cure rate in postoperative intracranial neurosurgical infections: a Spanish multicenter retrospective study.

Asensi V, Vázquez-Fernández C, Suárez-Díaz S, Asensi-Díaz E, Carrasco-Antón N, García-Reyne A, Panero I, Muñoz MV, Guerra JM, Arístegui J, Sepúlveda MA, García-Calvo X, Dueñas C, Biosca M, Chiminazzo V, Collazos J.

BMC Infect Dis. 2024 Nov 26.24(1):1345.

PMID: 39587499

FI: 3,4

A Contemporary Picture of Coagulase-Negative Staphylococcal Endocarditis: A Nationwide GAMES Cohort Study.

Palom-Grau C, Cuervo G, Muñoz P, Marín Arriaza M, Martínez-Sellés M, González-Ramallo V, de Alarcón A, Poyato-Borrego M, Rodríguez-García R, Rodríguez-Esteban MÁ, Fariñas MC, González-Rico C, Goenaga MÁ, Ojeda-Burgos G, Goikoetxea-Agirre AJ, Calderón-Parra J, López-Azor JC, García-Vázquez E, Loeches B, Quintana E, García de la Mària C, Llopis J, Miró JM, GAMES Investigators (Members of GAMES: Alfonso Cabello Úbeda, Ricardo Fernández Roblas).

J Am Coll Cardiol. 2025 Feb 04.85(4):305-318.

PMID: 39580721

FI: 21,7

New antibiofilm strategies for the management of nontuberculous mycobacteria diseases.

Cano-Fernández M, Esteban J.

Expert Opin Pharmacother. 2024 Oct.25(15):2035-2046.

PMID: 39365052

FI: 2,5

How can we optimize the diagnostic and therapeutic approach to pneumonia? Expert opinion-based recommendations.

Fernández-Ruiz M, Castón JJ, Del Pozo JL, Carratalà J, Fortún J, Salavert M, Torre-Cisneros J, Aguado JM, members of the OPENIN (Optimización de procesos clínicos para el diagnóstico y tratamiento de infecciones) Group, Fernández Cruz A, Ventura A, Loeches B, Dueñas C, Tomás C, Navarro D, Oltra R, Resino-Foz E, García Vázquez E, Míguez E, Merino E, Braojos F, Martínez FJ, López-Medrano Pérez F, Machuca I, Cobo J, López Contreras J, Reguera JM, Ruiz Mesa JD, Tiraboschi J, Abella L, Masiá M, Del Toro López MD, Díaz López MD, Carrasco-Antón N, Merchante N, Muñoz P, Torres R, Rodríguez R, Mata-Forte T, Abril V.

Enferm Infecc Microbiol Clin (Engl Ed). 2024 Oct.42(8):442-452.

PMID: 39112116

FI: 0

Efficacy and safety of colistin plus beta-lactams for bone and joint infection caused by fluoroquinolone-resistant gram-negative bacilli: a prospective multicenter study.

Mancheño-Losa M, Murillo O, Benavent E, Sorlí L, Riera M, Cobo J, Benito N, Morata L, Ribera A, Sobrino B, Fernández-Sampedro M, Múñez E, Bahamonde A, Barbero JM, Del Toro MD, Villa J, Rigo-Bonnin R, Luque S, García-Luque I, Oliver A, Esteban J, Lora-Tamayo J.

Infection. 2024 Sep 09.

PMID: 39249177

FI: 5,4

Cutibacterium Species Valvular and Cardiac Device-Related Infective Endocarditis: Contemporary Data From the GAMES Prospective Cohort (2008-2023).

Alonso-Menchén D, Marín-Arriaza M, Villamarín M, Fernández-Hidalgo N, López-Azor JC, Calderón-Parra J, Águila Fernández-Paniagua E, Hidalgo-Tenorio C, de Alarcón A, Goenaga-Sánchez MÁ, Rodríguez-Esteban MÁ, García Vázquez E, Grillo S, Bouza Santiago E, Muñoz P, Grupo de Apoyo al Manejo de la Endocarditis Infecciosa en España (GAMES) Investigators (Members of GAMES: Alfonso Cabello Úbeda, Ricardo Fernández Roblas).

Clin Infect Dis. 2024 Sep 26.79(3):663-671.

PMID: 38913722

FI: 8,2

Bacteriophage Therapy on an In Vitro Wound Model and Synergistic Effects in Combination with Beta-Lactam Antibiotics.

Santamaría-Corral G, Aguilera-Correa JJ, Esteban J, García-Quintanilla M.

Antibiotics (Basel). 2024 Aug 24.13(9).

PMID: 39334975

FI: 4,3

Isolation and characterization of two novel bacteriophages against carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae.

Senhaji-Kacha A, Bernabéu-Gimeno M, Domingo-Calap P, Aguilera-Correa JJ, Seoane-Blanco M, Otaegi-Ugartemendia S, van Raaij MJ, Esteban J, García-Quintanilla M.

Front Cell Infect Microbiol. 2024.14:1421724.

PMID: 39268483

FI: 4,6

Synergism between remdesivir and ribavirin leads to SARS-CoV-2 extinction in cell culture.

García-Crespo C, de Ávila AI, Gallego I, Soria ME, Durán-Pastor A, Somovilla P, Martínez-González B, Muñoz-Flores J, Mínguez P, Salar-Vidal L, Esteban-Muñoz M, Cañar-Camacho E, Ferrer-Orta C, Zuñiga S, Sola I, Enjuanes L, Esteban J, Fernández-Roblas R, Gadea I, Gómez J, Verdaguer N, Domingo E, Perales C.

Br J Pharmacol. 2024 Aug.181(15):2636-2654.

PMID: 38616133

FI: 6,8

Point mutations at specific sites of the nsp12-nsp8 interface dramatically affect the RNA polymerization activity of SARS-CoV-2.

Ferrer-Orta C, Vázquez-Monteagudo S, Ferrero DS, Martínez-González B, Perales C, Domingo E, Verdaguer N.

Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Jul 16.121(29):e2317977121.

PMID: 38990941

FI: 9,4

A Novel Bacteriophage Infecting Multi-Drug- and Extended-Drug-Resistant Pseudomonas aeruginosa Strains.

Santamaría-Corral G, Pagán I, Aguilera-Correa JJ, Esteban J, García-Quintanilla M.

Antibiotics (Basel). 2024 Jun 03.13(6).

PMID: 38927189

FI: 4,3

Persistent Mild Increase of Human Chorionic Gonadotropin in a Male Patient with Testicular Pain.

Castillo Pérez C, Rodríguez Alonso L, Cebrián Ballesteros M, Torrubia B, Torrejón MJ.

J Appl Lab Med. 2024 Jun 12.

PMID: 38864113

FI: 1,8

Biofilm prevention concentration of clarithromycin against clinically relevant species of nontuberculous mycobacteria.

Senhaji-Kacha A, Akir A, Broncano-Lavado A, Esteban J.

Rev Esp Quimioter. 2024 Jun.37(3):266-269.

PMID: 38602224

FI: 1,9

Risk Factors for Therapeutic Failure and One-Year Mortality in Patients with Intramedullary Nail-Associated Infection after Trochanteric and Subtrochanteric Hip Fracture Repair.

Pfang B, Villegas García MA, Blanco García A, Auñón Rubio Á, Esteban J, García Cañete J.

Antibiotics (Basel). 2024 May 18.13(5).

PMID: 38786191

FI: 4,3

Biofilm on total joint replacement materials can be reduced through electromagnetic induction heating using a portable device.

Enrique CG, Medel-Plaza M, Correa JJA, Sarnago H, Acero J, Burdio JM, Lucía Ó, Esteban J, Gómez-Barrena E.

J Orthop Surg Res. 2024 May 20.19(1):304.

PMID: 38769535

FI: 2,8

Prosthetic Joint Infections Caused by Mycobacterium tuberculosis Complex-An ESGIAI-ESGMYC Multicenter, Retrospective Study and Literature Review.

Auñon A, Salar-Vidal L, Mahillo-Fernandez I, Almeida F, Pereira P, Lora-Tamayo J, Ferry T, Souèges S, Dinh A, Escudero R, Menéndez Fernández-Miranda C, Rico A, Rossi N, Esteban J.

Microorganisms. 2024 Apr 24.12(5).

PMID: 38792679

FI: 4,1

Comparative Efficacy of Continuous Ceftazidime Infusion vs. Intermittent Bolus against In Vitro Ceftazidime-Susceptible and -Resistant Pseudomonas aeruginosa Biofilm.

El Haj C, Agustí E, Benavent E, Soldevila-Boixader L, Rigo-Bonnin R, Tubau F, Torrejón B, Esteban J, Murillo O.

Antibiotics (Basel). 2024 Apr 09.13(4).

PMID: 38667020

FI: 4,3

In Vivo Detection of Staphylococcus aureus Infections Using Radiolabeled Antibodies Specific for Bacterial Toxins.

González MI, González-Arjona M, Cussó L, Morcillo MÁ, Aguilera-Correa JJ, Esteban J, Kestler M, Calle D, Cerón C, Cortes-Canteli M, Muñoz P, Bouza E, Desco M, Salinas B.

Int J Biomed Imaging. 2024.2024:3655327.

PMID: 38665417

FI: 3,3

Reply to Qu et al., ""Quasispecies are constantly selected through virus-encoded intracellular reproductive population bottlenecking"".

Domingo E, Martínez-González B, García-Crespo C, Somovilla P, de Ávila AI, Soria ME, Durán-Pastor A, Perales C.

J Virol. 2024 Apr 16.98(4):e0004624.

PMID: 38445886

FI: 4

SARS-CoV-2 mutant spectra as variant of concern nurseries: endless variation?

Martínez-González B, Soria ME, Mínguez P, Lorenzo-Redondo R, Salar-Vidal L, López-García A, Esteban-Muñoz M, Durán-Pastor A, Somovilla P, García-Crespo C, de Ávila AI, Gómez J, Esteban J, Fernández-Roblas R, Gadea I, Domingo E, Perales C.

Front Microbiol. 2024.15:1358258.

PMID: 38559344

FI: 4

Microevolution, reinfection and highly complex genomic diversity in patients with sequential isolates of Mycobacterium abscessus.

Buenestado-Serrano S, Martínez-Lirola M, Herranz-Martín M, Esteban J, Broncano-Lavado A, Molero-Salinas A, Sanz-Pérez A, Blázquez J, Ruedas-López A, Toro C, López-Roa P, Domingo D, Zamarrón E, Ruiz Serrano MJ, Muñoz P, Pérez-Lago L, García de Viedma D.

Nat Commun. 2024 Mar 28.15(1):2717.

PMID: 38548737

FI: 14,7

Biofilm Development by Mycobacterium avium Complex Clinical Isolates: Effect of Clarithromycin in Ultrastructure.

Akir A, Senhaji-Kacha A, Muñoz-Egea MC, Esteban J, Aguilera-Correa JJ.

Antibiotics (Basel). 2024 Mar 16.13(3).

PMID: 38534698

FI: 4,3

Epidemiology and Risk Factors of Mycotic Aneurysm in Patients With Infective Endocarditis and the Impact of its Rupture in Outcomes. Analysis of a National Prospective Cohort.

Calderón-Parra J, Domínguez F, González-Rico C, Arnaiz de Las Revillas F, Goenaga MÁ, Alvarez I, Muñoz P, Alonso D, Rodríguez-García R, Miró JM, De Alarcón A, Antorrena I, Goikoetxea-Agirre J, Moral-Escudero E, Ojeda-Burgos G, Ramos-Martínez A, Spanish Collaboration on Endocarditis (GAMES) (Members of GAMES: Alfonso Cabello Úbeda, Ricardo Fernández Roblas).

Open Forum Infect Dis. 2024 Mar.11(3):ofae121.

PMID: 38500574

FI: 3,8

Feasibility of using real-world free thyroxine data from the US and Europe to enable fast and efficient transfer of reference intervals from one population to another.

Kurka H, Dilba P, Perez CC, Findeisen P, Gironés IG, Katayev A, Alonso LR, Valcour A, Rehberg T, Weber B, Donner H, Thorenz A.

Pract Lab Med. 2024 Mar.39:e00382.

PMID: 38463194

FI: 1,7

Incipient functional SARS-CoV-2 diversification identified through neural network haplotype maps.

Delgado S, Somovilla P, Ferrer-Orta C, Martínez-González B, Vázquez-Monteagudo S, Muñoz-Flores J, Soria ME, García-Crespo C, de Ávila AI, Durán-Pastor A, Gadea I, López-Galíndez C, Moran F, Lorenzo-Redondo R, Verdaguer N, Perales C, Domingo E.

Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Mar 05.121(10):e2317851121.

PMID: 38416684

FI: 9,4

Assessment of novel POCT to evaluate liver function.

Minea C, Gruson D.

Pract Lab Med. 2024 Mar.39:e00367.

PMID: 38328513

FI: 1,7

An unusual case of endotipsitis: persistent infection and migration to the right atrium of a transjugular intrahepatic portosystemic shunt (TIPS).

Calpena-Martínez S, Carrasco-Antón N, Cleary-Martín C, Hernández-Estefanía R, Esteban J, Cabello-Úbeda A, Petkova-Saiz E.

Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2024 Mar.43(3):623-626.

PMID: 38231308

FI: 3,7

Potential value of a rapid syndromic multiplex PCR for the diagnosis of native and prosthetic joint infections: a real-world evidence study.

Pascual S, Noble B, Ahmad-Saeed N, Aldridge C, Ambretti S, Amit S, Annett R, O'Shea SA, Barbui AM, Barlow G, Barrett L, Berth M, Bondi A, Boran N, Boyd SE, Chaves C, Clauss M, Davies P, Dianzo-Delgado IT, Esteban J, Fuchs S, Friis-Hansen L, Goldenberger D, Golle A, Groonroos JO, Hoffmann I, Hoffmann T, Hughes H, Ivanova M, Jezek P, Jones G, Ceren Karahan Z, Lass-Flörl C, Laurent F, Leach L, Horsbøll Pedersen ML, Loiez C, Lynch M, Maloney RJ, Marsh M, Milburn O, Mitchell S, Moore LSP, Moffat L, Murdjeva M, Murphy ME, Nayar D, Nigrisoli G, O'Sullivan F, Öz B, Peach T, Petridou C, Prinz M, Rak M, Reidy N, Rossolini GM, Roux AL, Ruiz-Garbajosa P, Saeed K, Salar-Vidal L, Salas Venero C, Selvaratnam M, Senneville E, Starzengruber P, Talbot B, Taylor V, Trebše R, Wearmouth D, Willinger B, Wouthuyzen-Bakker M, Couturier B, Allantaz F.

J Bone Jt Infect. 2024.9(1):87-97.

PMID: 38601005

FI: 1,8

Fluoride anodic films on stainless-steel fomites to reduce transmission infections.

Conde A, Voces D, Medel-Plaza M, Perales C, de Ávila AI, Aguilera-Correa JJ, de Damborenea JJ, Esteban J, Domingo E, Arenas MA.

Appl Environ Microbiol. 2024 Feb 21.90(2):e0189223.

PMID: 38289132

FI: 3,9